①改变精子和胚胎运行动线
子宫腺肌病患者子宫体积增大，使得子宫出现解剖学异常。这就像本来需要两天走完的路程，一下子多出一天的距离，从而改变精子和胚胎的运行动线，导致着床失败，或者不能着床。
②子宫异常蠕动
有人曾经做过腺肌病和正常女性对照实验，将放射性颗粒放置于阴道前穹隆，正常女性放射性颗粒运输到优势卵泡一侧的输卵管。70%子宫腺肌病合并不孕的女性放射性颗粒仍然停留在子宫腔内，且有22%的患者放射性颗粒被运输到了优势卵泡的对侧，仅有8%的患者放射性颗粒被运输到优势卵泡同侧。这说明腺肌病患者内膜蠕动异常，过度蠕动或蠕动不良，影响精子运送和胚胎种植。
③种植窗改变
有文献研究发现，47.2%子宫腺肌病患者种植窗子宫内膜处于非容受期改变，这个比例远远高于非腺肌病患者21.6%。内膜分析也体现了这种改变。许多种植窗口期的内膜标志物在子宫腺肌病患者都出现异常表达，如白血病抑制因子（LIF）、整合素b、HOXA10、骨桥蛋白等，降低了内膜对胚胎的容受性。
④内膜蜕膜化不良
内膜表面氧化自由基增加，毒害胚胎，内膜的孤儿核受体表达下降，引起内膜蜕膜化不良，影响胚胎种植和发育，导致早期流产增加。
⑤免疫被过度激活
子宫腺肌病的内膜中人类白细胞抗原-G（HLA-G）和白介素10表达增高，自然杀伤细胞毒性被激活，巨噬细胞表达改变增加免疫攻击效应，影响胚胎着床。子宫腺肌病患者还过度表达P450芳香化酶，导致雌孕激素比例失调，扰乱母胎界面。
⑥流产、早产等不良妊娠
子宫腺肌病患者妊娠后子宫质硬纤维化，妊娠期宫腔扩张受限，宫腔压力高，还有炎性因子如前列腺素的释放，增加子宫腺肌病患者流产、早产、胎膜早破的风险。
子宫腺肌病，很多姐妹对这个疾病比较陌生，不知道它和自然流产息息相关，更是我们反复流产人群高发的一种妇科疾病。2014年一项比较大的荟萃分析，纳入928个试管周期，腺肌病患者流产率为31.9%，非腺肌病患者流产率为14.1%。腺肌病患者流产率比正常患者高出一倍都要多。